【科技】上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
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3月25日,国际学术期刊elife是中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究小组的最新论文anextensiveprogramofperiodicalternativesplicinglinkedtocellcyclepro 该商家首次发现了rna可变切断的时间序列控制,阐述了细胞周期中rna切断的周期性变动对细胞分裂增殖的调节作用。 在机理上,进一步明确了sr蛋白激酶clk1在这些周期性可变切割中的作用机制。
选择性切割对蛋白头发表达多样化起重要作用: 90%以上的人类基因可以通过可变切割产生不同功能的蛋白亚型。 在生物体中,可变剪接受到严格控制,同一基因在不同组织的细胞中或同一组织的不同发育阶段多表现为不同的剪接亚型,剪接的异常控制与癌症等多种疾病密切相关。
迄今为止的报告中,细胞周期是通过控制特定基因的周期性表达来协调实现的。 该研究首次发现人类基因组普遍存在rna可变切断的周期性变动,这种周期性切断控制也是细胞周期的重要调控机制。 研究人员用rna测序的方法将两个连续细胞周期的细胞转录组解析为深度测序,发现约1300个基因会发生细胞周期的可变剪接变化。 这些基因大部分对转录水平没有周期性变化的影响,提示周期性可变切割是控制不依赖周期性转录的另一个细胞周期的新机制。
研究人员还发现这些周期性可变切断基因的大部分可变切断是由sr蛋白激酶clk1控制的clk1自身的表达水平在细胞周期这一过程中通过自我抑制循环,随着细胞周期时相的变化而周期性变化 如果进一步参与clk1的表达水平,clk1的表达水平下降直接引起细胞周期紊乱,抑制细胞增殖,而clk1的表达水平上升与各种癌症的发生密切相关,clk1活性的抑制限制了许多癌细胞的生长
该研究详细揭示了clk1控制细胞周期可变切断的分子机制,首次提出周期可变切断可能是癌症发生的另一种控制机制。 研究工作是在研究员王泽峰的指导下完成的,得到了中国国家自然科学基金委员会、美国国立卫生研究院等经费的支持。
细胞周期相关的可变拼接的检测
标题:【科技】上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
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