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【科技】中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装

来源:国际科技时报作者:何鸿宝更新时间:2021-01-25 16:06:01阅读:

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最近,记者从中国科学院海洋研究所获悉,中国科学家正式完成了拟刺参基因组的测序和组装。 这在国际上是第一次。 这一研究成果对刺参生物学和遗传育种研究有重要的科学意义,对我国刺参产业的迅速发展具有重要的推动作用。

【科技】中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装

这项研究由国家科学技术部973,863计划、国家基金委员会、中国科学院和山东省科学技术厅、青岛市科学技术部资助。 这一成果由中国科学院海洋研究所研究员杨红生、相建海两个团队共同完成,在天津生物芯片技术企业的技术支持下,刺参较多,突破了杂基因组测序和组装技术的瓶颈,采用新一代序列测量技术突破了132gb的优质dna序列 科研人员利用比较高、杂度高的基因组组装创新战略,国际上首次成功组装野生刺参的基因组,目前得到的框架全长达到765mb,栈群contig n50达到112kb,这个数值在国际上发展到现在 初步检测表明,功能基因区复盖95%以上。

【科技】中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装

上世纪50年代,中国科学院海洋研究所的科学研究者开展了海参的形态分类和古典生物学研究,调查了中国海参的分布和生物多样化的特征,明确了其分类学地位。 刺参,又称刺参,属于棘皮动物门,主要分布在中国黄渤海和俄罗斯、南北朝鲜和日本等东北亚海域。 刺参特殊的进化地位、独特的繁殖生活史以及夏眠、污垢和再生、自溶等生物学现象,具有重要的科研价值。 刺参也是中国目前20种可食用海参中质量最好、经济价值最高的种类,年中国刺参养殖面积达21.5万公顷,总产量达19.4万吨,产值近300亿元,全国当年海水养殖产值

【科技】中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装

十多年来,杨红生等人比较刺参的基础生物学、生态学和遗传育种应用开展了契舍系统研究,取得了非常丰富的科技成果,在理解刺参的夏眠、再生和行为学方面取得了一些新的认识,建立了刺参的遗传育种群体,耐高温高产

近两年来,我国刺参养殖业面临育苗变态困难、成活率下降、养殖病害严重、种质退化、质量不好等一系列问题,杨红生团队与相建海团队合作,共同开展刺参基因组学研究,刺参基因新闻全

全基因组序列的成功解读作为刺参认识创新的里程碑,为刺参的繁殖发育、免疫调控、营养代谢、遗传分析提供了重要的理论支持,有力地推进刺参的重要经济性状分析、分子标记的选育和全基因组遗传育种,刺参的夏眠、再生

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