【科技】上海巴斯德所等发现卡波氏肉瘤病毒编码基因参与调控宿主基因表达的
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11月4日,国际学术期刊journalofvirology, 中国科学院上海巴斯德研究所肿瘤病毒研究组的研究论文:打开genome-widemappingofthebindingsitesandstructuralanalysisofkshvirf2revealitisadna-Bibi ty 作为连疱疹病毒代码的virf2转录因子,基因组上dna结合部位的检测和virf2蛋白结合分析”。
卡氏肉瘤病毒( kaposissarcomaassociatedherpesvirus,kshv )又称人疱疹病毒8型,可引起卡氏肉瘤、原发性外渗透淋巴瘤及多中心客户疾病。 kshv参与了与4个个体类干扰素调节因子相同的蛋白virfs的编码。 virfs在kshv的生命周期和肿瘤的形成过程中起着重要的作用。 因此,进一步了解kshvvirfs的功能性可以为肿瘤病毒肿瘤发生机制的研究提供新的线索。
virf2在kshv的生命周期中首先抑制干扰素信号通路,有助于更好地建立病毒的持续感染。 例如,virf2作为负控制因子抑制irf-1的表达,干扰素和β; ( INF & beta; )的信号路径。 另外,virf2通过与isgf3复合体中的蛋白质相互作用,也可以抑制下游isg基因的表达,抑制干扰素信号通路。 前期的研究表明,kshv的virf2对基因表达的控制主要是通过蛋白-蛋白相互作用完成的,但virf2是否能作为转录因子控制宿主基因尚不清楚。
上海巴斯德肿瘤病毒研究组研究生胡海岬、董家珍在研究员蓝科的指导下,与中国科学院高能物理研究所董宇辉研究组合作,通过chip-seq手段检测virf2在人类基因组上的dna结合部位,virf2 通过凝胶转移实验( emsa )和q-pcr实验,确认了virf2可以作为转录因子控制宿主pik3c3等基因。 为了深入研究virf2和dna的结合能力,研究者通过蛋白质结构分析,确认了virf2的dna结合区( virf2dbd )蛋白构象,发现了virf2dbd蛋白&alpha。 3个区域的第82位和第85位的精氨酸是virf2的dna结合能力所必需的。 使这两个部位的氨基酸变异后,发现变异的基因会影响virf2作为转录因子的宿主基因的控制能力。 该研究首次证实kshv编码的virf2具有dna结合能力,可以作为转录因子控制宿主基因,对kshv的感染和肿瘤研究具有一定的功能意义。
这项研究得到了国家自然科学基金的积分项目和国家973计划等项目的经费支持。
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